哈布斯堡王朝后期繁衍甚广，西班牙国王卡洛斯一世( Carlos I，即德意志国王、神圣罗马帝国皇帝查理五世) 后分为西班牙哈布斯堡王朝、奥地利哈布斯堡王朝(后被哈布斯堡-洛林皇朝取代)2个分支。
哈布斯堡家族，身世显赫，公元六世纪的祖先为法国阿尔萨斯公爵，后来扩张至瑞士北部的阿尔高州，并在1020年筑起鹰堡，名为哈布斯堡，并逐渐将势力扩展到莱茵河西岸流域。
1273年，哈布斯堡公爵鲁道夫一世当选德意志国王(但未加冕为皇帝)。
1282年12月27日鲁道夫一世夺取被波希米亚国王奥托卡二世占有的奥地利与施蒂利希公国，即分封于自己的两个儿子阿尔布雷希特与鲁道夫，自此奥地利划归哈布斯堡皇室拥有长达600余年。
鲁道夫一世1291年逝世后，拿骚家族的阿道夫被选举为国王，但因其与英国结盟很快遭到厌弃，鲁道夫一世之子阿尔布雷希特一世被选为对立国王，并在1298年击败阿道夫，正式登基。
1308年，阿尔布雷希特一世被自己的侄子士瓦本的约翰杀害，自此后虽然阿尔布雷希特的次子腓特烈三世曾被选举为对立国王，并与巴伐利亚的路德维希四世共治，然而其后的100年间哈布斯堡家族的势力开始退缩到以奥地利为主的家族领地，并把南阿尔萨斯、布赖施高(Breisgau)和帝国内的其他一些领地陆续划入治下。
14世纪期间，新成立的瑞士联邦不断向德国南部扩张，导致哈布斯堡家族失去祖先建立的鹰堡。自此，哈布斯堡王朝的基地正式由瑞士南部的鹰堡，转移到下奥地利的维也纳。
哈布斯堡家族在失去神圣罗马帝位后，继续保有奥地利与施蒂利希为领地。历任奥地利公爵都不断地扩大公国的统治范围，并在14世纪中叶开始自称"大公"，以期与选帝侯的权位相抗衡，但该称号未得到皇帝查理四世的承认。
哈布斯堡家族将奥地利公国划分为若干个省统治，这最终导致了内外奥地利分治。
1379年，哈布斯堡家族的两位兄弟，阿尔布雷希特三世(Albrecht III)和利奥波德三世(Leopold III)签定协议。阿尔布雷希特的子孙将拥有奥地利大公国(后来被称为下奥地利)，即奥地利中东部，利奥波德的后裔则坐拥外奥地利公国，统治领域包括奥地利西部、南阿尔萨斯和位于德国西南领地。
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