字文化及、王薄军队又有粮食吃了，他们于是又不投降了，继续坚守聊城抗击唐军。
李神通统领下的唐贝州刺史赵君德领兵奋勇登城，李神通看他要成功了，又赶紧敲铜锣收兵。
赵君德孤军奋战，又听到鸣金只好退兵。
他回营责问李神通：
“眼看我已领兵登城成功，你为什么鸣金收兵？”
李神通说：
“窦建德大军到了，咱已经没法攻城了呀！”
赵君德登上高坡向东方远望，哪有窦建德大军的影子？一兵一卒也望不见。
他知道李神通怕他抢了头功。不由长叹一声：
“这李神通亏是李渊皇帝的族弟，人家投降他不接受，攻城能成他赶紧叫停，这智商无语！
不见李神通有啥神通，只见他一窍不通！唉——！”
过了一夜，第二天天亮，唐军才听着见战鼓咚咚、长钟当当作响。知道这是窦建德的大队兵马，真的来了。
李神通见他声势浩大，人数远超唐军，只好领兵退去。
宇文化及得唐军已退走，攻城的只剩下窦建德农民军，便领兵放胆出城，同窦建德将士作战。
没承想交战不到几个回合，宇文化及兵士被窦建德军队杀得七零八落，纷纷逃进城里。
宇文化及拍马回城，他的败军也蜂拥而入，重新关闭城门拒守。
窦建德领兵围攻，王薄领兵登上城墙抵御，相持到天黑。
这天晚上，攻城越发猛烈，王薄怕守不住，急忙派人去告诉宇文化及，让他领他的属下兵士一起守卫。
使者返回说：“宇文化及已经入睡了。”
王薄气愤地说：
“这都什么时候了，他还敢安心睡觉？
想这等嗜酒好色，荒淫无度之人，怎么能干成事？我苦守城池,他在睡觉，我为什么还为他效力？”
说完命令部下打开城门，迎接窦建德军队进城。
窦建德领兵进城，搜捕捉拿宇文化及。卑劣无耻的宇文化及正搂着萧皇后睡觉。
他猛然听见屋外喊杀声震天响，方才匆匆起床，穿好衣服，向外面胡乱奔逃。
刚好这个时候，窦建德的兵士赶到，几个兵士上前一把抓住了守文化及，找来绳子把他捆绑得结结实实。
这时，字文智及、杨士览、武元达、许弘仁、孟景等，有的骑上马快逃，有的挥舞兵器同窦军将士拼死搏斗。
结果他们逃到无路可逃被拦截住，打得气力用尽乖乖就缚，都被窦军兵将捉住。
窦建德率兵消灭了宇文化及属下全部兵士。
窦建德率兵到皇后屋门外，对屋里的萧皇后喊到：
“臣民窦建德向皇后大人问安！
叛贼宇文化及已被我的部下兵士捉拿擒住。
请皇后出来与臣民说话！”
萧皇后自隋炀帝被杀，被迫委身叛贼宇文化及，颠沛流离，甘苦自知。
得知宇文化及被捉，萧皇后喜忧参半、百感交集。
她从室内缓缓送出来，表情复杂，一脸的尴尬羞愧。
她为自己丈夫祸国殃民感到惭愧，她为自己身不由己，不得不屈从杀夫仇敌宇文老贼感到羞耻。
她觉得无颜面对天下臣民百姓。
她对窦建德缓缓地说：
“感谢窦将军抓了叛贼首领。
窦将军和兵士们劳苦了！
谢将军神勇助我出危难！”
她一脸羞愧的样子看着窦建德。
窦建德朝着萧皇后恭恭敬敬行了臣子见皇上的大礼。
窦建德请示萧皇后，获得赞同认可后，吩咐部下在聊城广场上摆设祭台，立了隋炀帝亡灵牌位，他和部将穿孝服致哀。
然后命令兵士把宇文智及、杨士览、武元达，许弘仁、孟景五个人押到牌位前，当众宣读他们弑君叛逆之罪，在众将士的喊杀声中，命令行刑兵士砍下他们首级，摆在炀帝灵位前，祭祀炀帝。
窦建德命人把宇文化及和他的两个儿子宇文承基、宇文承趾关押在三辆囚笼马车上，让他仨观看斩杀这五个叛臣祭祀炀帝全过程。
宇文化及早已没有了往日的骄横威风，他站在囚车中头发蓬乱，面如死灰。他的双腿颤抖不停。
他的两个儿子在囚车里吓得嚎哭，干脆闭上眼睛不敢观看斩杀五叛贼过程。
祭祀完毕，窦建德命令兵士收了传国玉印和皇帝出行仪仗等物品，让兵士押解宇文化及囚车，押解装载金银财宝和宫女的牛车。
窦建德又请萧皇后坐上辇车，全军浩浩荡荡离开聊城，返回乐寿都城。
在乐寿都城，窦建德在广场召开兵民大会，宣布宇文化杀君叛国罪状,用车裂的酷刑处死了宇文化及和他的两个儿子。
窦建德这次剿灭宇文化及，缴获了大量金银财帛，他妻子曹淑贞建议把这些财宝分发给属下全体将士。
曹淑贞自己仍然穿粗布衣裙，不肯私拿缴获的丝绸锦缎给自己缝制华丽衣服。
窦建德人品端正、不好女色，除了妻子曹淑贞，宫内只有十几个干杂活的婢女。
这次他收得宇文化及一路携带来的隋宫宫女2000人，下令让部下派兵护送，全部安排她们返回到各自家乡，和她们的亲人团聚。
只有萧皇后没有去处，窦建德命令下属从皇宫安排一处好房子，让她安居。
这时隋炀帝堂妹远嫁突厥的义成公主得到消息，从突厥那边派人前来，迎接她的落难流离的嫂子萧皇后。
窦建德请示萧皇后：
“皇后大人，你愿意到塞外去大草原上生活吗？”
萧皇后说：
“我的妹妹义成公主在那里，我愿意去陪伴她。”
于是窦建德派人护送萧皇后以及萧皇后一直带在身边的隋炀帝小孙子杨政道一起前往。
到了突厥，义成公主领兵出城迎接。义成公主见到了落难丧夫、颠沛流离的兄嫂萧皇后。
萧皇后见到义成公主百感交集，千言万语不知从何说起，她俩抱在一起放声大哭。在场的人劝不住，也只好在边上陪同她俩一起落泪。
突厥处罗可汗是始毕可汗的弟弟，兄长死后他继承了可汗帝位。
处罗可汗对萧皇后恭敬有礼，吩咐下属周到安排她好的住处，让她适应草原生活。
隋炀帝堂妹义成公主嫁给突厥可汗的过程是这样：
599年,为结好突厥,隋文帝选隋宗室之女封为义成公主,远嫁草原上的突厥启民可汗。
609年启民可汗去世。其子始毕可汗继位。义成公主改嫁始毕可汗。
619年，始毕可汗病逝，他弟处罗可汗继位，义成公主再次嫁给处罗可汗。
处罗可汗听从义成公主主意，同意帮助重建大隋。他说：
“我的父亲因大隋才立为可汗，我要报答隋朝恩情，讨伐大唐。”
为重建大隋，处罗可汗在定襄立隋炀帝小孙子杨政道为隋王，重设百官。
处罗可汗620年病逝，义成公主拥立处罗可汗弟弟继位，就是颉利可汗。
义成公主又嫁给颉利可汗。颉利可汗对义成公主言听计从，一生与大唐作对。
窦建德送走了萧皇后，写了奏表派人送往洛阳隋小朝廷，说明了处死叛贼宇文化及的情形。隋小皇帝杨侗册封窦建德为“夏王”。
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